兵籍調查完成以後，如果不打算繼續升學之役男，接著就要進行徵兵檢查，「徵兵檢查」就是所謂的「身體檢查」，也就是一般人所謂的「兵役體檢」，是徵兵制度中最重要的一環。
檢查的目的是為了確定役男的身體健康狀況，以決定役男是不是適合服兵役及應服那一種役別。
90年6月開始實施『役男體檢新制』，將原來役男於 19 歲之年的徵兵檢查，修正為在學緩徵原因消滅前1至9 個月辦理，以縮短體檢至等候入營之時間（這也就是說，役男體檢新制實施以後，役男於19歲之年，一定要先完成兵籍調查，但是徵兵檢查則等到學業即將完成之前1至9個月才辦理）。
役男接受徵兵檢查前，如果身體有任何疾病，請備妥相關疾患的一般用診斷證明書及其他相關佐證資料，並於徵兵檢查當日攜往體檢場主動告知檢查的醫師，以維護自己的權益。
另外，役男如果是在他縣市就學或就業，不方便回到戶籍地接受檢查時，收到「徵兵檢查通知書」時，可以至內政部役政司網站申請於就學或居住地之徵兵檢查醫院代檢。